Ню Йорк има нужда от герои. Градът тъне в мрак, откакто Шрьодер и предвожданите от него нинджи от клана Фут са затегнали желязната си хватка около всички - от полицията до политиците. Бъдещето изглежда също толкова мрачно, докато четирима прокудени братя, излезнали от градските канали, не откриват съдбата си като Костенурките нинджа. Те ще трябва да се съюзят с безстрашната репортерка Ейприл О‘Нийл и нейния оператор майтапчия Върнан Фенуик, за да спасят града и разгадаят коварните планове на Шрьодер.